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杭州冷冻电子显微镜技术用途

来源: 发布时间:2023年07月08日

单颗粒冷冻电镜技术的图像处理技术:经过多年的发展,目前冷冻电镜的数据处理部分主要包含了以下的流程:(1)衬度传递函数的修正(CTFcorrection);(2)样品分子投影数据的筛选(particleselection);(3)二维投影数据的分类和降噪(2Danalysis);(4)三维模型的重构和优化(3Dreconstructionandrefinement);(5)多重构象的结构分析(heterogeneityanalysis);(6)对重建结构分辨率的分析(structureresolutionassessment);(7)结合生物化学原理和实验数据对三维结构的解读(modelinterpretationandvalidation)。冷冻电镜技术中的单颗粒分析法:是针对单个粒子进行重构的技术。杭州冷冻电子显微镜技术用途

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冷冻电镜技术解析结构主要风险在:A.样品很不稳定,样品寄送过来的时候,已经降解或者聚集,无法进行后续处理;B.样品在冷冻制样的过程中,可能会被冻碎,从而无法进行后续处理;C.样品纯度可能很好,但是均一度很差,从而难以获得样品的高分辨结构;D.我们关心的区域可能在整个复合体中有很强的柔性,从而经过二维或者三维平均后,我们关心区域的分辨率会比较差甚至看不见,达不到我们的预期;E.一些配体,比如药物前体分子,分子量太小,不一定能在电镜的密度图中观测到;F.对于合适的样品,我们冷冻制样需要优化的参数有很多,包括样品浓度的优化,blottime的优化,温度的优化,grid规格(铜网或者金网)的优化等一系列条件的优化。因此冷冻电镜制样需要丰富的经验和充足的机时支持,不同的实验者,成功率可能差别很大。杭州冷冻电子显微镜技术用途冷冻电镜技术之冷冻蚀刻电子显微镜优点:样品通过冷冻,可使其微细结构接近于活的状态。

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冷冻电镜技术原理之电子晶体学:利用电子显微镜对生物大分子在一维、二维以致三维空间形成的高度有序重复排列的结构(晶体)成像或者收集衍射图样,进而解析这些生物大分子的结构,这种方法称为电子晶体学。其适合的样品分子量范围为10~500kD,Zgao分辨率约0.19nm。该方法与X射线晶体学的类似之处在于均需获得高度均一的生物大分子的周期性排列,不同之处是利用电子显微镜除了可以获得晶体的电子衍射外还可以通过获得晶体的图像来进行结构解析。

冷冻电镜技术未来之路在何方?除了蛋白等生物大分子外,生物样品还有很重要的一面是细胞和组织。即使是目前有很多重要的蛋白结构都得到了埃米级别的解析,但由于它们都是纯化出来的,已经脱离了原来位置,就如同一片树叶脱离了大树,研究的再深刻,目前也只是一叶遮目,不要说推测这片树叶在森林里的位置,即使是在哪颗特定大树上的生长部位和结构都很难说。因此解析细胞或组织这样大尺度的高分辨精细结构具有更普遍的生物学意义。冷冻电镜技术具有更接近天然状态、适用研究对象普遍等优势。

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冷冻电镜技术测定结构的几种方法:X射线晶体学、NMR、和冷冻电镜技术各有优缺点,将这几种方法结合共同研究结构与功能将使结构生物学家对所研究的分子有更为全部的理解,而这些信息是单用任何一个方法所无法获得的。将X射线晶体模型与经电镜获得的密度图重合可以对电镜三维重构的结构作更详尽的解释,例如将牛的水通道(AQP1,与人的有90%同源性)的高分辨率的晶体结构与先前用冷冻电镜技术重构出来的人的中等分辨率水通道的三维结构进行比较,可以进一步确定冷冻电镜获得的中等分辨率的结构,同时也显示出了冷冻电镜技术的优势和局限性。另一方面,较低分辨率的电镜三维重构模型可以用来解释病毒或大分子的晶体结构。而且,将X射线晶体的精细结构与冷冻电镜的重构模型结合构建生物大分子复合物在发挥功生物学功能过程中出现的构像变化模型。这很大程度增加了我们对于复杂分子的活动机制的理解。电子显微技术,成像技术,计算机技术,生物信息技术等不同学科的结合,将为我们提供研究生命现象与本质的强有力的手段。冷冻电镜技术之冷冻蚀刻电子显微镜优点:可研究细胞内的膜性结构及内含物结构。杭州冷冻电子显微镜技术用途

冷冻电镜技术之冷冻蚀刻电子显微镜优点:样品经冷冻断裂蚀刻后,能够观察到不同劈裂面的微细结构。杭州冷冻电子显微镜技术用途

冷冻电镜是什么?冷冻电镜技术的应用:冷冻电镜主要用于扫描电镜的很低温冷冻制样和传输技术,英文名Cryo-SEM,利用冷冻电镜技术可实现直接观察液体和半液体及对电子束敏感的样品,如生物、高分子材料等。尤其是在戴口罩戴口罩中,利用冷冻电镜技术可解析病毒结构、推测其侵染人体细胞的路径等传播原理发挥了重要作用,为人类攻坚戴口罩防护、研发疫苗提供了重要的理论依据。冷冻电镜是什么?样品经过很低温冷冻、断裂、镀膜制样(喷金/喷碳)等处理后,通过冷冻传输系统放入电镜内的冷台(温度可至-185℃)即可进行观察。其中,快速冷冻技术可使水在低温状态下呈玻璃态,减少冰晶的产生,从而不影响样品本身结构,冷冻传输系统保证在低温状态下对样品进行电镜观察。杭州冷冻电子显微镜技术用途

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